A Sociedade Excursionista e Espeleológica possui um grande acervo de mapas que ilustram as características morfológicas das cavernas. A mapoteca conta com cerca de 340 mapas já contabilizados pela entidade, sendo o material mais antigo registrado é de 1937.
Um mapa para ser completo precisa conter o nome da caverna, o município e o estado, os autores da topografia e cartografia, a escala, o ano da topografia, as legendas e convenções, a planta baixa, o corte vertical e o perfil. Entretanto, a mapoteca da SEE conta com diversos mapas históricos incompletos, que também descrevem o ambiente cavernícola de forma precisa. Suas ilustrações podem conter peculiaridades da caverna como alguns espeleotemas não tão comuns como coralóides, dente-de-cão, pérolas, cortina, entre outros. Para manter os mapas de forma cuidadosa, a SEE realiza encontros semanais para a revisão dos mapas e atualização do cadastro.